西安交通大学苏州研究院，是苏州市人民政府和西安交通大学联合共建的副厅级教育科研事业单位，具有独立法人资格。研究院于2004年5月，在苏州工业园区独墅湖科教创新区挂牌成立，目前注册资金为4592万元人民币。吴军华担任常务副院长兼法人代表，杨民助、余海荭担任副院长，李季、张剑锋担任院长助理。2013年5月，西安交通大学苏州教学科研基地党工委成立，吴军华担任常务副书记。教学科研基地包括与研究院一体化发展的研究生院（苏州），周荣莲担任副院长，吴骏刚担任主任；包括西安交大纳米科技与工程技术学院（苏州），连崑担任副院长，白煜担任院长助理。 苏州研究院的主要任务是为西安交通大学在苏州建设中外合作办学基地、教育培训基地、科学研究基地和科技成果转化基地。为推动地方经济发展，服务社会，苏州研究院按企业化、市场化模式运行，实施实验室-人才培养-科学研究-成果产业化一体化联动发展，注重为地方培养人才，科学研究注重成果转化和产业化。